Podatnicy mogą w praktyce napotkać wątpliwości co do sposobu rozliczenia subwencji z PFR. Subwencja ta jest z zasady zwrotna, niemniej znaczna jej część może zostać umorzona jeśli podatnik będzie kontynuował prowadzenie działalności gospodarczej.
Zgodnie z obowiązującymi przepisami zwrot subwencji następuje w odniesieniu do ustalonej części subwencji:
Zwrot 100% wartości subwencji następuje w przypadku:
(i) zaprzestania prowadzenia działalności gospodarczej (w tym w razie zawieszenia prowadzenia działalności gospodarczej) przez przedsiębiorcę,
(ii) otwarcia likwidacji przedsiębiorcy (jeżeli dotyczy) lub